BaseScope ISH 分析
BaseScope ISH 手动分析能够在空间和形态学背景下，以单细胞灵敏度可视化特定 RNA 位点。BaseScope 分析可用于检测外显子连接/剪接变异体、短/高度同源 RNA 序列（50-300 个碱基）和点突变等，并可在单个细胞中使用单一双 Z 探针原位分析这些现象，它甚至能检测出单个（一个）核苷酸的差异。我们提供两种 BaseScope ISH 分析，即 BaseScope 红色分析和 BaseScope 双重分析。
BaseScope 红色分析
BaseScope 红色分析
可检测短 RNA 靶标、高度同源序列。RNA 突变、外显子连接、剪接变异体、环状 RNA 和融合。
可在空间形态学背景下辨别高度同源的 MAGEA 基因家族。
单一 ZZ 探针，专门用于识别转录本可变区内的序列。
BaseScope 双重分析
BaseScope 双重分析
同时可视化两个 RNA 靶标，并且保持单细胞分辨率。
使用 RNA ISH 细胞标记探针和编辑特异性探针（例如 CRISPR/Cas9) 组成的双重探针来鉴定基因编辑。
在空间转录组水平上可视化体内基因编辑异质性。
BaseScope ISH 分析应用示例
外显子连接/剪接变异体
外显子连接/剪接变异体
剪接变异体示例：检测胶质母细胞瘤中的 EGFRvIII+（使用 BaseScope v2 分析）
- 外显子连接/剪接变异体
- 环状 RNA (circRNA)
- 基因融合
- 基因敲除 (KO)
短序列
短序列
基因编辑示例：鉴定细胞类型特异性基因编辑（使用 BaseScope 双重分析）
- 基因疗法/AAV
- 短/高度同源基因序列 (50-300nt)
- T 细胞克隆中的 T 细胞受体 (TCR) 和互补决定区 (CDR) 序列
- 基因编辑/CRISPR
- miRNA 前体
- 微外显子
